Bio-Rad Image Lab™ Software - Manual (Page 5)

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| Table of Contents
Chapter 6 Acquiring Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
The Protocol Setup Window . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
Creating a Protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
Setting Up a New Protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72
Step 1. Gel Imaging for Single-Channel Protocols . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
Step 2. Detect Lanes and Bands. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78
Step 3. Analyze Molecular Weight. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79
Step 4. Specify Output . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 82
Review Protocol Settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
Creating a Multichannel Image from Single Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
Editing a Saved Protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85
Positioning the Gel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87
Running a Protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88
Running Signal Accumulation Mode (SAM) Protocols . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
Saving Signal Accumulation Mode (SAM) Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90
Setting Up a Custom Application . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91
Regression Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93
Application Tables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94
Chapter 7 Viewing Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97
Displaying Gel Images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 98
Display Gel Options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 98
Zoom Tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 99
Fit in Window . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100
Image Transform . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100
Image Colors . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102
3-D Projection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103
Image Info . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104
Displaying Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104
Analysis Table Options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105
Lane and Band Table Measurement Definitions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 107
Volume Measurement Definitions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
Lane Profile . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109
Standard Curve . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112
Report . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113